シリーズ第52巻は、前巻に引き続き、環境保全と絶滅危惧種の保護のために活動する人々を紹介する。今回は、ダーウィンが進化論の着想を得、その後世界遺産第1号となったことで有名な太平洋ガラパゴス諸島（エクアドル）が舞台。1998年の火山噴火でガラパゴスゾウガメが絶滅の危機に瀕した際、軍とガラパゴス国立公園局、民間団体のスタッフらが命がけでゾウガメたちを救いだしたという実話をもとにしたストーリー。
【あらすじ】◆ジャックとアニーは、魔法のツリーハウスで、いろいろな国や時代へ冒険の旅に出かけていた。◆ある日ふたりは、大きな白い鳥に導かれ、太平洋に浮かぶ島におりたつ。◆そこは、かつてダーウィンが進化論のヒントを得、その後世界遺産の第１号として登録された、希少動物の宝庫といわれるガラパゴス諸島だった。◆ふたりは魔法のバッジのおかげで<世界のカメのエキスパート>として歓迎されるが、そのとき島の火山が大噴火。希少なガラパゴスゾウガメの生息地に、溶岩流が迫っていることが判明。◆ジャックとアニーは、カメの専門家として、ガラパゴスゾウガメの救出のため、ヘリに乗って現地に飛ぶことに……！