八百屋のお父さんが持ってきたタマネギのダンボールの中にヘンテコな球根を見つけた小学３年生のサキちゃん。ためしに植木鉢に球根を植えて育てみると、不思議な生き物に大変身！　葉っぱのしっぽをふって、まるで犬みたい！？　長年、犬を飼いたいと思っていたサキちゃんは、友だちのノダちゃんといっしょに育て方を調べますが、花屋さんに相談しても、図書館で調べても、なかなか見つかりません。図書館で出会った司書見習いの女の子、司書子ちゃん協力のもと、図書館の魔法本コーナーで見つけた「マンドラゴラ」の図鑑には、マンドラゴラとは、ひとりでにあるきまわる魔法の植物で、たくさんの種類があり、非常に危険なものもあるが、そうでないものも多いと書いてあって……。